En la infinita y eterna grieta del espacio y tiempo dos entidades que jamas debieron encontrarse chocan en un combate de grandes proporciones. Una de ella es la deidad del tiempo Dialga quien logra herir a su contraparte Palkia la deidad del espacio. Mientras tanto en otro lugar un hombre lee el diario de un famoso arquitecto llamado Godey. En este se predice lo que podria ser la destruccion del mundo debido a fuerzas poderosas que colisionan unas con otras.